Sur chacune de ces stations, de nombreux paramètres sont mesurés afin d'évaluer les différentes altérations de l'eau :
- matières organiques et oxydables : cette altération indique la présence de matières susceptibles de consommer l'oxygène de la rivière,
- matières azotées : cette altération caractérise la présence de nutriments susceptibles d'alimenter la croissance des végétaux et de nuire au développement des poissons,
- nitrates : cette altération présente la teneur en nitrates, qui sont à la fois des nutriments pour les végétaux et des éléments indésirables pour la fabrication d'eau potable,
- matières phosphorées : cette altération est le principal facteur influant sur le développement excessif d'algues microscopiques,
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phytoplancton : cette altération illustre le développement de micro-algues en suspension dans l'eau.
Des suivis sont aussi réalisés sur la teneur en micropolluants* (cf. lexique) et la qualité biologique de l'eau (observation des organismes vivants).